De anmälningspliktiga sjukdomarna delas in i fyra nivåer:
•Allmänfarliga* (33 sjukdomar)
•Av de allmänfarliga är tre även samhällsfarliga (Ebola, SARS, smittkoppor) och kräver extraordinära smittskyddsåtgärder(3 kap. 8§)
•Övriga anmälningspliktiga som även är smittspårningspliktiga (18 sjukdomar)
•Övriga anmälningspliktiga som inte behöver smittspåras (17 sjukdomar). Av dessa är tre anmälningspliktiga endast från laboratoriet: influensa, infektion med ESBL-bildande Enterobacteriaceae samt infektion orsakad av "atypiska mykobakterier".
* Med allmänfarliga sjukdomar avses smittsamma sjukdomar som kan vara livshotande, innebära långvarig sjukdom, svårt lidande eller medföra andra allvarliga konsekvenser och där det finns möjlighet att förebygga smittspridning genom åtgärder som riktas till den smittade. Detta är bakgrunden till att behandlande läkare ska ge särskilda förhållningsregler till patient som har eller misstänks ha en allmänfarlig sjukdom.
Utöver de sjukdomar som är anmälningspliktiga, kan behandlande läkare även rapportera annan sjukdom som är eller misstänks vara smittsam samt fått en anmärkningsvärd utbredning inom ett område eller uppträder i en elakartad form.
Utöver dessa infektioner är Creutzfeldt-Jakobs sjukdom och andra överförbara spongiforma encefalopatier hos människa anmälningspliktiga. För dessa sjukdomar ska dock anmälan göras direkt till Folkhälsomyndigheten enligt förordningen om anmälan av vissa allvarliga sjukdomar (1998:58).